システムエンジニアとして活躍することを目指す場合、ある程度のスキルを身につけないといけません。
まず押さえておきたいのが、システム開発に使われるプログラミング言語についてのスキルです。
これらを熟知していなければシステムの全体像を作り上げることは困難でしょう。
システムエンジニアが担当するのは、要件定義を始めとする上流工程と呼ばれるものです。
実際にシステムを作り上げるのは下流工程を担当するエンジニアですが、システムエンジニアがプログラミングのスキルを軽視してはいけません。
手掛けるシステムによって、最適なプログラミング言語は変わってくるので、できる限り色々なプログラミング言語について理解を深めておきたいところです。

そして、論理的思考のスキルも必須です。
システムの最適な仕様を決める上で役立ってくれます。
クライアント、あるいは自社が望むシステムについての要望をまとめ実現させるには、物事を筋道立てて考えること、つまり論理的思考のスキルが必要です。
また、論理的思考はプロジェクトで何らかのトラブルが起こった際に、トラブルの解決を図る上でも役立ってくれます。

システムエンジニアの上にプロジェクトマネージャーがいます。
プロジェクトマネージャーがマネジメントを主に手掛けるケースもあるものの、システムエンジニアが現場の責任者としてマネジメントをこなすケースも多いので、マネジメントスキルも必要です。
進行に遅れが出るなどのトラブルを起こす可能性を低くするためには、マネジメントスキルを活かし、計画的にプロジェクトを進めていくことが欠かせません。